DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Trypanosoma brucei'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2C7V_A_MTXA1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2) 		9 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
PRO A  99
PHE A 171
TYR A 174
PRO A 210
MET A 213
TRP A 221
 MTX A1272
2C7V_B_MTXB1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 12 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
PRO B  99
ASP B 161
PHE B 171
TYR B 174
LEU B 209
PRO B 210
MET B 213
GLU B 217
TRP B 221
 MTX B1272
2C7V_C_MTXC1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 12 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
PRO C  99
ASP C 161
PHE C 171
TYR C 174
LEU C 209
PRO C 210
MET C 213
GLU C 217
TRP C 221
 MTX C1272
2C7V_D_MTXD1272 2c7v MTX

DB00563
(Methotrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 10 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
PRO D  99
ASP D 161
PHE D 171
TYR D 174
PRO D 210
MET D 213
TRP D 221
 MTX D1272
2TOD_A_DMOA700 2tod DMO

DB06243
(Eflornithine) 		Trypanosoma
brucei 		PROTEIN (ORNITHINE
DECARBOXYLASE) 		PF00278
(Orn_DAP_Arg_deC)
PF02784
(Orn_Arg_deC_N)
no annotation 		6 TYR A 323
ASP B 332
CYS A 360
ASP A 361
TYR B 389
PHE A 397
 DMO A 700
2TOD_B_DMOB700 2tod DMO

DB06243
(Eflornithine) 		Trypanosoma
brucei 		PROTEIN (ORNITHINE
DECARBOXYLASE) 		PF00278
(Orn_DAP_Arg_deC)
PF02784
(Orn_Arg_deC_N)
no annotation 		5 ASP A 332
CYS B 360
ASP B 361
TYR A 389
PHE B 397
 DMO B 700
2TOD_C_DMOC700 2tod DMO

DB06243
(Eflornithine) 		Trypanosoma
brucei 		PROTEIN (ORNITHINE
DECARBOXYLASE) 		no annotation 5 ASP D 332
CYS C 360
ASP C 361
TYR D 389
PHE C 397
 DMO C 700
2TOD_D_DMOD700 2tod DMO

DB06243
(Eflornithine) 		Trypanosoma
brucei 		PROTEIN (ORNITHINE
DECARBOXYLASE) 		no annotation 5 ASP C 332
CYS D 360
ASP D 361
TYR C 389
PHE D 397
 DMO D 700
2WV2_A_TPFA1 2wv2 TPF

DB00196
(Fluconazole) 		Trypanosoma
brucei 		LANOSTEROL
14-ALPHA-DEMETHYLASE 		PF00067
(p450) 		9 TYR A 103
MET A 106
PHE A 110
TYR A 116
ALA A 287
ALA A 291
THR A 295
LEU A 356
MET A 460
 TPF A   1
2X2N_A_X2NA1480 2x2n X2N

DB01263
(Posaconazole) 		Trypanosoma
brucei 		LANOSTEROL
14-ALPHA-DEMETHYLASE 		PF00067
(p450) 		14 TYR A 103
PHE A 105
MET A 106
PHE A 110
TYR A 116
ILE A 209
PRO A 210
ALA A 211
ALA A 287
ALA A 291
THR A 295
LEU A 356
MET A 360
MET A 460
 X2N A1480
2X2N_B_X2NB1479 2x2n X2N

DB01263
(Posaconazole) 		Trypanosoma
brucei 		LANOSTEROL
14-ALPHA-DEMETHYLASE 		no annotation 13 TYR B 103
PHE B 105
MET B 106
PHE B 110
TYR B 116
PRO B 210
ALA B 211
ALA B 287
ALA B 291
THR B 295
LEU B 356
MET B 360
MET B 460
 X2N B1479
2X2N_C_X2NC1479 2x2n X2N

DB01263
(Posaconazole) 		Trypanosoma
brucei 		LANOSTEROL
14-ALPHA-DEMETHYLASE 		no annotation 13 TYR C 103
PHE C 105
MET C 106
PHE C 110
TYR C 116
PRO C 210
VAL C 213
ALA C 287
ALA C 291
THR C 295
LEU C 356
MET C 360
MET C 460
 X2N C1479
2X2N_D_X2ND1479 2x2n X2N

DB01263
(Posaconazole) 		Trypanosoma
brucei 		LANOSTEROL
14-ALPHA-DEMETHYLASE 		no annotation 13 ILE D  46
TYR D 103
PHE D 105
MET D 106
PHE D 110
TYR D 116
PRO D 210
ALA D 287
ALA D 291
THR D 295
LEU D 356
MET D 360
MET D 460
 X2N D1479
2X9G_A_LYAA1270 2x9g LYA

DB00642
(Pemetrexed) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
no annotation 		16 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
PRO A  99
ASP A 161
CYS A 168
MET A 169
PHE A 171
TYR A 174
VAL A 206
LEU A 209
PRO A 210
MET A 213
GLU A 217
TRP A 221
HIS D 267
 LYA A1270
2X9G_B_LYAB1270 2x9g LYA

DB00642
(Pemetrexed) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 15 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
PRO B  99
ASP B 161
CYS B 168
MET B 169
PHE B 171
TYR B 174
VAL B 206
LEU B 209
PRO B 210
MET B 213
TRP B 221
HIS C 267
 LYA B1270
2X9G_C_LYAC1270 2x9g LYA

DB00642
(Pemetrexed) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 15 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
PRO C  99
ASP C 161
CYS C 168
MET C 169
PHE C 171
TYR C 174
VAL C 206
LEU C 209
PRO C 210
MET C 213
TRP C 221
HIS B 267
 LYA C1270
2X9G_D_LYAD1270 2x9g LYA

DB00642
(Pemetrexed) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
no annotation 		15 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
PRO D  99
ASP D 161
CYS D 168
MET D 169
PHE D 171
TYR D 174
VAL D 206
LEU D 209
PRO D 210
MET D 213
TRP D 221
HIS A 267
 LYA D1270
2X9V_A_TMQA1270 2x9v TMQ

DB01157
(Trimetrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2) 		11 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
ASP A 161
CYS A 168
TYR A 174
LEU A 209
PRO A 210
MET A 213
GLU A 217
TRP A 221
 TMQ A1270
2X9V_B_TMQB1270 2x9v TMQ

DB01157
(Trimetrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 9 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
ASP B 161
CYS B 168
TYR B 174
LEU B 209
PRO B 210
MET B 213
 TMQ B1270
2X9V_C_TMQC1270 2x9v TMQ

DB01157
(Trimetrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 10 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
ASP C 161
CYS C 168
PHE C 171
TYR C 174
LEU C 209
PRO C 210
MET C 213
 TMQ C1270
2X9V_D_TMQD1270 2x9v TMQ

DB01157
(Trimetrexate) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 9 SER D  95
PHE D  97
ASP D 161
CYS D 168
PHE D 171
TYR D 174
LEU D 209
PRO D 210
MET D 213
 TMQ D1270
3BMC_A_FOLA270 3bmc FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2) 		11 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
PRO A  99
PHE A 171
TYR A 174
VAL A 206
PRO A 210
MET A 213
GLU A 217
TRP A 221
 FOL A 270
3BMC_B_FOLB270 3bmc FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2) 		11 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
PRO B  99
CYS B 168
PHE B 171
TYR B 174
PRO B 210
MET B 213
GLU B 217
TRP B 221
 FOL B 270
3BMC_C_FOLC270 3bmc FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE None 12 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
PRO C  99
CYS C 168
PHE C 171
TYR C 174
LEU C 209
PRO C 210
MET C 213
GLU C 217
TRP C 221
 FOL C 270
3BMC_D_FOLD270 3bmc FOL

DB00158
(Folic
Acid) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE None 12 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
PRO D  99
CYS D 168
PHE D 171
TYR D 174
VAL D 206
PRO D 210
MET D 213
GLU D 217
TRP D 221
 FOL D 270
3H9U_A_ADNA439 3h9u ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE 		PF00670
(AdoHcyase_NAD)
PF05221
(AdoHcyase) 		10 LEU A  51
HIS A  52
THR A  54
GLN A  56
THR A  57
LEU A 346
GLY A 351
HIS A 352
MET A 357
PHE A 361
 ADN A 439
3H9U_B_ADNB438 3h9u ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE 		no annotation 10 HIS B  52
THR B  54
GLN B  56
THR B  57
ASN B 345
LEU B 346
GLY B 351
HIS B 352
MET B 357
PHE B 361
 ADN B 438
3H9U_C_ADNC438 3h9u ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE 		no annotation 10 LEU C  51
HIS C  52
THR C  54
GLN C  56
THR C  57
LEU C 346
GLY C 351
HIS C 352
MET C 357
PHE C 361
 ADN C 438
3H9U_D_ADND438 3h9u ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSYLHOMOCYSTEINA
SE 		no annotation 10 LEU D  51
HIS D  52
THR D  54
GLN D  56
THR D  57
LEU D 346
GLY D 351
HIS D 352
MET D 357
PHE D 361
 ADN D 438
3JQ7_A_DX2A271 3jq7 DX2

DB00384
(Triamterene) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		PF13561
(adh_short_C2) 		10 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
ASP A 161
TYR A 174
VAL A 206
LEU A 209
PRO A 210
MET A 213
TRP A 221
 DX2 A 271
3JQ7_B_DX2B271 3jq7 DX2

DB00384
(Triamterene) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		PF13561
(adh_short_C2) 		8 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
ASP B 161
TYR B 174
LEU B 209
PRO B 210
TRP B 221
 DX2 B 271
3JQ7_C_DX2C270 3jq7 DX2

DB00384
(Triamterene) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		no annotation 8 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
ASP C 161
TYR C 174
VAL C 206
LEU C 209
PRO C 210
 DX2 C 270
3JQ7_D_DX2D270 3jq7 DX2

DB00384
(Triamterene) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		no annotation 9 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
ASP D 161
TYR D 174
LEU D 209
PRO D 210
MET D 213
TRP D 221
 DX2 D 270
3JQA_A_DX4A270 3jqa DX4

DB00352
(Tioguanine) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		PF13561
(adh_short_C2) 		6 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
ASP A 161
TYR A 174
PRO A 210
 DX4 A 270
3JQA_B_DX4B270 3jqa DX4

DB00352
(Tioguanine) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		PF13561
(adh_short_C2) 		6 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
ASP B 161
TYR B 174
PRO B 210
 DX4 B 270
3JQA_C_DX4C270 3jqa DX4

DB00352
(Tioguanine) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		None 6 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
ASP C 161
TYR C 174
PRO C 210
 DX4 C 270
3JQA_D_DX4D270 3jqa DX4

DB00352
(Tioguanine) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE
1 		PF13561
(adh_short_C2) 		6 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
ASP D 161
TYR D 174
PRO D 210
 DX4 D 270
3QFX_A_CP6A602 3qfx CP6

DB00205
(Pyrimethamine) 		Trypanosoma
brucei 		BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE 		PF00186
(DHFR_1) 		12 VAL A  32
ALA A  34
ILE A  47
ASP A  54
MET A  55
PHE A  58
THR A  86
SER A  89
LEU A  90
ILE A 160
TYR A 166
THR A 184
 CP6 A 602
3QFX_B_CP6B702 3qfx CP6

DB00205
(Pyrimethamine) 		Trypanosoma
brucei 		BIFUNCTIONAL
DIHYDROFOLATE
REDUCTASE-THYMIDYLAT
E SYNTHASE 		no annotation 12 VAL B  32
ALA B  34
ILE B  47
ASP B  54
MET B  55
PHE B  58
THR B  86
SER B  89
LEU B  90
ILE B 160
TYR B 166
THR B 184
 CP6 B 702
4N09_A_ADNA401 4n09 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSINE KINASE PF00294
(PfkB) 		16 CYS A  12
ASN A  13
LEU A  15
ASP A  17
LEU A  39
GLY A  63
SER A  64
ASN A  67
CYS A 123
LEU A 134
ALA A 136
LEU A 138
PHE A 169
ASN A 295
GLY A 296
ASP A 299
 ADN A 401
4N09_B_ADNB401 4n09 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSINE KINASE no annotation 17 CYS B  12
ASN B  13
LEU B  15
ASP B  17
LEU B  39
GLY B  62
GLY B  63
SER B  64
ASN B  67
CYS B 123
LEU B 134
ALA B 136
LEU B 138
PHE B 169
ASN B 295
GLY B 296
ASP B 299
 ADN B 401
4N09_C_ADNC401 4n09 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSINE KINASE no annotation 17 CYS C  12
ASN C  13
LEU C  15
ASP C  17
LEU C  39
GLY C  62
GLY C  63
SER C  64
ASN C  67
CYS C 123
LEU C 134
ALA C 136
LEU C 138
PHE C 169
ASN C 295
GLY C 296
ASP C 299
 ADN C 401
4N09_D_ADND401 4n09 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Trypanosoma
brucei 		ADENOSINE KINASE no annotation 17 CYS D  12
ASN D  13
LEU D  15
ASP D  17
LEU D  39
GLY D  62
GLY D  63
SER D  64
ASN D  67
CYS D 123
LEU D 134
ALA D 136
LEU D 138
PHE D 169
ASN D 295
GLY D 296
ASP D 299
 ADN D 401
4RXD_A_RISA1404 4rxd RIS

DB00884
(Risedronate) 		Trypanosoma
brucei 		FARNESYL
PYROPHOSPHATE
SYNTHASE 		PF00348
(polyprenyl_synt) 		10 LEU A 100
ASP A 103
ASP A 107
ARG A 112
GLN A 172
LYS A 212
THR A 213
GLN A 252
ASP A 255
LYS A 269
 RIS A1404
4RXD_B_RISB1504 4rxd RIS

DB00884
(Risedronate) 		Trypanosoma
brucei 		FARNESYL
PYROPHOSPHATE
SYNTHASE 		no annotation 10 LEU B 100
ASP B 103
ASP B 107
ARG B 112
GLN B 172
LYS B 212
THR B 213
GLN B 252
ASP B 255
LYS B 269
 RIS B1504
4RXD_C_RISC1600 4rxd RIS

DB00884
(Risedronate) 		Trypanosoma
brucei 		FARNESYL
PYROPHOSPHATE
SYNTHASE 		no annotation 10 LEU C 100
ASP C 103
ASP C 107
ARG C 112
GLN C 172
LYS C 212
THR C 213
GLN C 252
ASP C 255
LYS C 269
 RIS C1600
5JDC_A_6JPA302 5jdc 6JP

DB01094
(Hesperetin) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
no annotation 		10 ARG A  14
SER A  95
PHE A  97
ASP A 161
MET A 163
TYR A 174
LEU A 209
PRO A 210
TRP A 221
HIS D 267
 6JP A 302
5JDC_B_6JPB302 5jdc 6JP

DB01094
(Hesperetin) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE no annotation 9 ARG B  14
SER B  95
PHE B  97
ASP B 161
MET B 163
TYR B 174
LEU B 209
PRO B 210
TRP B 221
 6JP B 302
5JDC_C_6JPC302 5jdc 6JP

DB01094
(Hesperetin) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
no annotation 		10 ARG C  14
SER C  95
PHE C  97
ASP C 161
MET C 163
TYR C 174
LEU C 209
PRO C 210
TRP C 221
HIS B 267
 6JP C 302
5JDC_D_6JPD302 5jdc 6JP

DB01094
(Hesperetin) 		Trypanosoma
brucei 		PTERIDINE REDUCTASE PF13561
(adh_short_C2)
no annotation 		11 ARG D  14
SER D  95
PHE D  97
ASP D 161
MET D 163
TYR D 174
VAL D 206
LEU D 209
PRO D 210
TRP D 221
HIS A 267
 6JP D 302
5K50_A_ACTA1403 5k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Trypanosoma
brucei 		L-THREONINE
3-DEHYDROGENASE 		PF01370
(Epimerase) 		5 MET A1081
SER A1082
VAL A1083
GLY A1184
ALA A1185
 ACT A1403
5K50_C_ACTC1403 5k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Trypanosoma
brucei 		L-THREONINE
3-DEHYDROGENASE 		None 4 MET C1081
SER C1082
VAL C1083
GLY C1184
 ACT C1403
5K50_J_ACTJ1404 5k50 ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Trypanosoma
brucei 		L-THREONINE
3-DEHYDROGENASE 		None 4 MET J1081
THR J1119
TYR J1144
TRP J1280
 ACT J1404